Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpa1P57784 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms