Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms