Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gsc2P56916 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gsc2P56916 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gsc2P56916 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms