Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bace1P56818 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms