Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmoP56726 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmoP56726 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmoP56726 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmoP56726 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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