Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TdgP56581 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TdgP56581 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TdgP56581 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TdgP56581 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms