Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd38P56528 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd38P56528 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms