Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
StomP54116 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
StomP54116 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
StomP54116 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
StomP54116 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
StomP54116 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
StomP54116 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
StomP54116 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
StomP54116 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms