Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms