Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms