Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms