Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TspoP50637 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TspoP50637 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms