Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms