Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms