Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BckdhaP50136 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdhaP50136 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BckdhaP50136 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdhaP50136 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdhaP50136 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdhaP50136 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdhaP50136 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdhaP50136 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms