Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms