Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PtpreP49446 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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PtpreP49446 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtpreP49446 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtpreP49446 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtpreP49446 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtpreP49446 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtpreP49446 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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