Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp3P49194 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms