Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rab11bP46638 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rab11bP46638 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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