Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syt1P46096 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms