Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf4P43488 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms