Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nkx1-2P42580 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms