Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3caP42337 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3caP42337 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms