Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tnfsf9P41274 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms