Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LtbP41155 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LtbP41155 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms