Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fen1P39749 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fen1P39749 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms