Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms