Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms