Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd22P35329 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms