Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn11P35235 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms