Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pola2P33611 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pola2P33611 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms