Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp13P33435 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp13P33435 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp13P33435 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp13P33435 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp13P33435 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp13P33435 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp13P33435 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mmp13P33435 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mmp13P33435 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mmp13P33435 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mmp13P33435 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp13P33435 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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