Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms