Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms