Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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