Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sstr1P30873 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms