Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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