Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Etv4P28322 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Etv4P28322 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Etv4P28322 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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