Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms