Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BrafP28028 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BrafP28028 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BrafP28028 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BrafP28028 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BrafP28028 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BrafP28028 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BrafP28028 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BrafP28028 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BrafP28028 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BrafP28028 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BrafP28028 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms