Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde6aP27664 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms