Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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