Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChgaP26339 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChgaP26339 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms