Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms