Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Scgb2b1-201ENSMUST00000189372 338 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd11P23813 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Dlx5-201ENSMUST00000052609 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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