Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkchP23298 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms