Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PparaP23204 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PparaP23204 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PparaP23204 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PparaP23204 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PparaP23204 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PparaP23204 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PparaP23204 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PparaP23204 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PparaP23204 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PparaP23204 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PparaP23204 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PparaP23204 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms