Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tap1P21958 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms