Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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