Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NefhP19246 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NefhP19246 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NefhP19246 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms